雖然，現在的經島和矢島連成一個島，但它們原本是兩個獨立的島嶼。1802年的大地震導致陸地隆起，兩個島才合二為一。形成方式雖然有所不同，但佐渡島本身也曾由兩個島嶼——大佐渡和小佐渡組成，經過多年的沙土堆積，最終合二為一。
這座島之所以被稱為“經島”，源於一個關於日蓮的傳說。
1271年，僧人日蓮因宣講《法華經》而招致鐮倉幕府的震怒，被流放到佐渡。在流放兩年零三個月後，他終於獲得赦免。據說，帶著赦免書的一名弟子，遭遇了海上風暴後被沖到的地方就是經島。在漆黑的夜晚，日朗徹夜誦經，一心念佛。據說，是附近寺廟的住持發現了他才得以被救。
赦免書，原本應由政府官員送達。弟子在沉船後帶來赦免書的說法或許並非歷史事實，而是源于弟子們對師父的敬愛之情。
而在矢島，流傳著這樣的傳說：說是用島上的竹子編制的箭擊敗了妖怪“鵺”。“經”和“矢”。在這個擁有兩個名字的島上，過去與現在靜靜地在此重疊。