“讀書就要抄寫，唯讀是記不住的，但抄寫後就不會忘記”

熊楠于慶應3年4月15日（西元1867年5月18日）出生于紀州藩城下町和歌山。父親是五金商人。熊楠這個名字是由守護子女為信仰的藤白神社授予的。藤白神社是熊野信仰中的王子社之一，院內有神木大楠樹。熊楠兄弟的名字使用了藤白的“藤”、熊野的“熊”、以及“楠”木中的一個字。使用“熊”和“楠”兩個字的，在兄弟中也只有熊楠一人。

熊楠的家，據他本人說是“和歌山市第一，和歌山縣內第五富翁”。可是，在父親入贅的當時家道已經中落。辛辛苦苦重建事業的父親，對孩子們的教育灌輸了節約的思想。因此，沒能自由地買書的熊楠，只要到鄰居家看就會找當時的百科全書《和漢三才圖會》，並沉迷於自己的知識的海洋中。

三才是指，天、地、人。代表宇宙中存在的一切。解說用的也是漢文，書裡面用的全是漢字。熊楠開始抄寫這本百科全書是在他8歲的時候。如今還保留著那本龐大的筆記本。這份抄寫筆記成為了支撐他之後的人生最堅實的基礎。