过去，门司港被指定为国家煤炭、大米、小麦、麦粉和硫磺的特别出口港。同时，作为长崎海关的分支机构成立于此。出口和进口量都非常优异。据说，在明治时代中期，这里的贸易收入超过了长崎港。仅次于大阪，居全日本第四位。并发展成为了日本领先的贸易港口之一。不久，在脱离了长崎海关管辖，成为了日本第七大海关"门司海关"。

明治和大正时代结束，进入昭和时代后被用作仓库发挥了其重要的作用。虽然，后来进行了翻新，但作为体现门司港复古的建筑之一，成为了可以感受到当时面貌的标的。