早在信仰诞生于户隠之前的五百万年前，这一带曾是汪洋大海。周边地区挖出来的化石能为此作证。这一带发现了如扇贝、鲍鱼、大白鲨和鲸鱼等许多海洋生物的化石。
从古人的视角来看的话，在群山环绕的户隠找到海洋生物的化石这件事，肯定超乎了他们的想象。古人认为，这些不可思议的东西就是传说中的一些生物的部分躯体。例如，被称为“天狗爪”的东西，其实是鲨鱼牙齿的化石，而被称为“龙骨”的是很久以前就灭绝的大象的化石。
其中，“龙骨”被古人们认为，刮掉一些粉末入药的话具有神奇的功效。户隐神社的中社的珍宝馆里有一件名为“牙笏”的藏品。它是由象牙制成的觐见皇上时候用的手板，但底部却被刮掉了一部分呈椭圆形。这是因为，当时的人们认为，手板是用中药药材制作而成的，因此挂掉了一部分。也许，这种想法也可以说是一种信仰！
