穿過大門，能看到一個和尚和一個孩子對視的雕像。這是關於這座寺院的，一個父親和兒子的故事。
感到這個世界的無常，父親離開了他正在懷孕的妻子，一個人來到高野山出家修行。之後，妻子一個人生下了一個男孩，並給他取名叫石童丸。茁壯成長的石童丸，有一天跟著母親進山去見他的父親。然而，高野山是禁止女性進入的。石童丸把母親留在了山腳下，獨自一個上山去找從沒見過面的父親。
“你是我的父親嗎？”。石童丸一路問每一個修行僧尋找著父親。父親，一眼就認出了石童丸是他的兒子。然而，作為一個拋棄了家室的他，不能承認自己就是父親。“你父親已經死了”。父親忍住眼淚對兒子說了謊，默默地目送非常失望的兒子下山。
從高野山下山後的石童丸，卻遭遇了更多的不幸。因長途跋涉，身心疲憊的母親也離開了他。失去了所有依靠的石童丸也決定出家修行。這時，腦海中浮現的是，告訴他的父親死了的那位修行僧。就這樣，在沒有透露父子關係的情況下，他們命運般地成為了師徒。
多年後的一天，父親做了一個夢。善光寺的阿彌陀佛叫他來一趟。父親雖然覺得很不可思議，卻立即前往善光寺參拜。通過每天的參拜，父親覺察到了他的內心變得越來越誠實。開始認為，在這裡修行也許能夠遵從自己的內心。他決定，如果石童丸來看他，會告訴他自己就是父親。父親悟到了阿彌陀佛感召他來到這裡，就是為了讓自己明白這個道理。
父親滿懷期待繼續在寺院修行。事與願違，石童丸在高野山進行修行時父親不幸離世。石童丸是通過夢境裡的阿彌陀佛，知道的父親的死訊。悲痛萬分的石童丸，在參拜善光寺後，在離善光寺不遠的西光寺為父親建了墓。
石童丸、父親、母親三人在他們活著的時候，沒能在一起一家人，如今終於可以在這裡團聚了。在善光寺大地震中父親的墓被摧毀。據說，父親的墓，跟石童丸的一樣，曾是九重塔結構。
