昭和天皇以生物學為愛好，在赤阪離宮內設置了生物學禦研究所。據說在離宮中發現了約10種粘菌，因此加深了進一步學習的興趣。大正15年（1926年）2月，攝政宮的生物學研究者·服部廣太郎博士向熊楠的弟子·小畔四郎提出了“想參觀粘菌標本集”的請求。小畔委託熊楠來選定一些標本。經過10個月的整理，熊楠將90件標本進獻給了當時身為皇太子攝政宮的昭和天皇。

熊楠的名字給攝政宮留下了深刻的印象。在昭和天皇紀南巡守之際，熊楠被指定為天皇敬獻敬講。無位無冠的研究者為天皇講課是極為破例的事情。在展示的海軍加藤寬治的來信中也寫到，天皇想必比自己更瞭解熊楠，御駕親臨的目的是為了神島以及熊楠。熊楠當時想必也是感慨萬分吧。

昭和4年（1929年）6月1日，天皇乘坐的戰艦“長門”駛進了田邊灣。62歲的熊楠，穿上了重新改好的長年愛穿的大衣，乘漁船去了神島。天皇一看到熊楠就脫下帽子低頭行禮。熊楠也深深地低下了頭行禮。於是，天皇也再次鞠躬，據說這個儀式持續了好一會兒。

天皇為了採集粘菌，登上了神島的山頂。而腿部受傷的熊楠很遺憾，沒能隨從天皇登頂。據說下了山的天皇遺憾地說了一句「有被砍伐的痕跡啊」。其實，這是對於粘菌一無所知的官員們為了天皇登山，提前進行的森林砍伐。而粘菌喜歡的倒木在這次行動中全部被砍伐，導致此次的採集沒能得到任何收穫。

下山後，在戰艦中熊楠敬獻了敬講。很快就到了規定的25分鐘，不過天皇示意“就這樣繼續講下去”。講課的時候，熊楠將田邊灣的生物標本放進了奶糖的紙箱裡帶了進去。通常，有這樣的好機會，都會把標本放到高級的桐木箱子裡展示。不過，天皇覺得這種做法很有趣，就對熊楠說了一句“這樣很好！”。

在講課中，熊楠最先講解了《Uga的標本》。是當地漁民信仰的傳說中的魚。據說，它像蛇一樣細長，有著紅白花紋，非常美。尾巴分成三個，戴著念珠一樣的珠子游泳……但是很少有人能看見它。因為即使萬一被漁夫發現了，也會馬上剪掉尾巴作為祈求大漁豐收的願望供奉給船靈。後來把實物魚拿到熊楠家的漁夫家族，一定知道熊楠喜歡珍奇的東西。觀察了實物後，熊楠發現所謂的Uga，是長吻海蛇的尾巴上附著叫處女海螺的甲殼類生物的緣故。 熊楠推測，在海螺上不小心掛上的幾根海藻，打撈上來的時候尾巴看上去好象分成了3段。

在敬講的一年後，為了紀念此次巡守，神島上立了刻有熊楠的和歌的石碑。
書法也是熊楠本人的字跡。以繁茂樹林做為脊背，正是建在當年天皇上陸的地方。

這裡歌頌著對島嶼自然的自豪感和對天皇的敬愛。在前言中介紹的昭和天皇禦制的詩歌，是在33年後的熊楠死後寫的。

“雨中眺望神島 想起紀伊國的熊楠”

兩座碑立在神島和番所山上，仿佛在相互呼應一般。